Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cacng5Q8VHW4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cacng5Q8VHW4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms