Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHT7

Gtf3a, Transcription factor IIIA, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3aQ8VHT7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gtf3aQ8VHT7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gtf3aQ8VHT7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms