Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE95

UPF0598 protein C8orf82 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VE95 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VE95 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VE95 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VE95 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VE95 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VE95 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VE95 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VE95 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VE95 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VE95 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VE95 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VE95 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VE95 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VE95 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VE95 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VE95 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q8VE95 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VE95 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VE95 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VE95 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VE95 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VE95 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VE95 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VE95 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VE95 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VE95 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VE95 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q8VE95 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8VE95 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8VE95 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8VE95 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8VE95 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8VE95 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q8VE95 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8VE95 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8VE95 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8VE95 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8VE95 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8VE95 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8VE95 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q8VE95 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VE95 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VE95 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VE95 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VE95 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VE95 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VE95 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VE95 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VE95 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VE95 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VE95 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VE95 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VE95 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VE95 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VE95 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VE95 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VE95 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VE95 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VE95 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VE95 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VE95 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VE95 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VE95 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q8VE95 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VE95 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VE95 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VE95 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VE95 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VE95 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VE95 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VE95 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VE95 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VE95 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VE95 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VE95 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VE95 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VE95 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VE95 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VE95 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VE95 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VE95 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VE95 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VE95 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VE95 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VE95 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VE95 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VE95 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VE95 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VE95 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VE95 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VE95 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VE95 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VE95 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VE95 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VE95 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VE95 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VE95 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VE95 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VE95 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VE95 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms