Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt25Q8VCW2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt25Q8VCW2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt25Q8VCW2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms