Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn4Q8VCH8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn4Q8VCH8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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