Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kdm4cQ8VCD7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Kdm4cQ8VCD7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kdm4cQ8VCD7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms