Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdk8Q8R3L8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdk8Q8R3L8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms