Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0A6

Vstm2a, V-set and transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2aQ8R0A6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vstm2aQ8R0A6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vstm2aQ8R0A6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms