Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hoxc12Q8K5B8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxc12Q8K5B8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms