Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sash3Q8K352 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sash3Q8K352 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sash3Q8K352 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sash3Q8K352 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sash3Q8K352 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sash3Q8K352 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sash3Q8K352 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Sash3Q8K352 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sash3Q8K352 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sash3Q8K352 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Sash3Q8K352 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sash3Q8K352 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sash3Q8K352 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sash3Q8K352 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sash3Q8K352 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms