Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Stn1Q8K2X3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Stn1Q8K2X3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stn1Q8K2X3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms