Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
1700001C19RikQ8K168 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
1700001C19RikQ8K168 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms