Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Afg3l2Q8JZQ2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Afg3l2Q8JZQ2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Afg3l2Q8JZQ2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms