Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trip10Q8CJ53 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trip10Q8CJ53 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms