Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rab11fip3Q8CHD8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rab11fip3Q8CHD8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rab11fip3Q8CHD8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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