Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Arhgap29Q8CGF1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Arhgap29Q8CGF1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Arhgap29Q8CGF1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Arhgap29Q8CGF1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Arhgap29Q8CGF1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Arhgap29Q8CGF1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Arhgap29Q8CGF1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap29Q8CGF1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap29Q8CGF1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap29Q8CGF1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap29Q8CGF1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap29Q8CGF1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap29Q8CGF1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap29Q8CGF1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap29Q8CGF1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap29Q8CGF1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap29Q8CGF1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap29Q8CGF1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap29Q8CGF1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Arhgap29Q8CGF1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arhgap29Q8CGF1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arhgap29Q8CGF1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arhgap29Q8CGF1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arhgap29Q8CGF1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arhgap29Q8CGF1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Arhgap29Q8CGF1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms