Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFF0

Parp11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp11Q8CFF0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Parp11Q8CFF0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Parp11Q8CFF0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms