Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ClasrpQ8CFC7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ClasrpQ8CFC7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms