Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkiras1Q8CEC5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkiras1Q8CEC5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms