Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
6030452D12RikQ8CD33 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
6030452D12RikQ8CD33 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms