Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Riox2Q8CD15 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Riox2Q8CD15 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Riox2Q8CD15 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms