Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Nhlrc3Q8CCH2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Nhlrc3Q8CCH2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Nhlrc3Q8CCH2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Nhlrc3Q8CCH2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nhlrc3Q8CCH2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nhlrc3Q8CCH2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nhlrc3Q8CCH2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nhlrc3Q8CCH2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nhlrc3Q8CCH2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nhlrc3Q8CCH2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nhlrc3Q8CCH2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nhlrc3Q8CCH2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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