Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCB4

Vps53, Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps53Q8CCB4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps53Q8CCB4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vps53Q8CCB4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms