Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp1Q8C8U0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ppfibp1Q8C8U0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1094.5 ms