Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe22Q8C6A8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms