Protein–RNA interactions for Protein: Q8C648

Gm10309, MCG125396, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10309Q8C648 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10309Q8C648 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10309Q8C648 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10309Q8C648 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10309Q8C648 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10309Q8C648 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10309Q8C648 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10309Q8C648 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10309Q8C648 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10309Q8C648 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10309Q8C648 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10309Q8C648 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10309Q8C648 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10309Q8C648 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10309Q8C648 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10309Q8C648 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10309Q8C648 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10309Q8C648 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10309Q8C648 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10309Q8C648 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10309Q8C648 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms