Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B1

Camsap2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camsap2Q8C1B1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Camsap2Q8C1B1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Camsap2Q8C1B1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms