Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R9

Lrrd1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrd1Q8C0R9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrd1Q8C0R9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Lrrd1Q8C0R9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Lrrd1Q8C0R9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrd1Q8C0R9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms