Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FarsaQ8C0C7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms