Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TnrQ8BYI9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TnrQ8BYI9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms