Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Kdm4aQ8BW72 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kdm4aQ8BW72 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kdm4aQ8BW72 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.8 ms