Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Usp38Q8BW70 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp38Q8BW70 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Usp38Q8BW70 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Usp38Q8BW70 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usp38Q8BW70 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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