Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW49

Ttc12, Tetratricopeptide repeat protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc12Q8BW49 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc12Q8BW49 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc12Q8BW49 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc12Q8BW49 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc12Q8BW49 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc12Q8BW49 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc12Q8BW49 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc12Q8BW49 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc12Q8BW49 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc12Q8BW49 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc12Q8BW49 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc12Q8BW49 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc12Q8BW49 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc12Q8BW49 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc12Q8BW49 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttc12Q8BW49 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc12Q8BW49 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms