Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Usp54Q8BL06 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp54Q8BL06 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms