Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rspo4Q8BJ73 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rspo4Q8BJ73 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms