Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
U2af1l4Q8BGJ9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1l4Q8BGJ9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms