Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrtm2Q8BGA3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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