Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Katnb1Q8BG40 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Katnb1Q8BG40 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms