Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sv2bQ8BG39 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sv2bQ8BG39 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sv2bQ8BG39 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms