Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cracr2bQ80ZJ8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cracr2bQ80ZJ8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms