Protein–RNA interactions for Protein: Q80YV3

Trrap, Transformation/transcription domain-associated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrrapQ80YV3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TrrapQ80YV3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TrrapQ80YV3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrrapQ80YV3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrrapQ80YV3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrrapQ80YV3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrrapQ80YV3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrrapQ80YV3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrrapQ80YV3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrrapQ80YV3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrrapQ80YV3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrrapQ80YV3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrrapQ80YV3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrrapQ80YV3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrrapQ80YV3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrrapQ80YV3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrrapQ80YV3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrrapQ80YV3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TrrapQ80YV3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrrapQ80YV3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrrapQ80YV3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrrapQ80YV3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TrrapQ80YV3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms