Protein–RNA interactions for Protein: Q80WT0

Jph4, Junctophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph4Q80WT0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Jph4Q80WT0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Jph4Q80WT0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Jph4Q80WT0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Jph4Q80WT0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Jph4Q80WT0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Jph4Q80WT0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Jph4Q80WT0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Jph4Q80WT0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Jph4Q80WT0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Jph4Q80WT0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Jph4Q80WT0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Jph4Q80WT0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Jph4Q80WT0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Jph4Q80WT0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Jph4Q80WT0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Jph4Q80WT0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Jph4Q80WT0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Jph4Q80WT0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Jph4Q80WT0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Jph4Q80WT0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Jph4Q80WT0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Jph4Q80WT0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms