Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ell3Q80VR2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ell3Q80VR2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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