Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b1Q80VQ0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b1Q80VQ0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b1Q80VQ0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b1Q80VQ0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b1Q80VQ0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b1Q80VQ0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b1Q80VQ0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b1Q80VQ0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b1Q80VQ0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Aldh3b1Q80VQ0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aldh3b1Q80VQ0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aldh3b1Q80VQ0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aldh3b1Q80VQ0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Aldh3b1Q80VQ0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Aldh3b1Q80VQ0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Aldh3b1Q80VQ0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Aldh3b1Q80VQ0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Aldh3b1Q80VQ0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Aldh3b1Q80VQ0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Aldh3b1Q80VQ0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms