Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Otop3Q80UF9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Otop3Q80UF9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Otop3Q80UF9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms