Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cep170bQ80U49 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cep170bQ80U49 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cep170bQ80U49 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep170bQ80U49 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep170bQ80U49 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep170bQ80U49 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep170bQ80U49 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep170bQ80U49 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep170bQ80U49 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cep170bQ80U49 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cep170bQ80U49 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cep170bQ80U49 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cep170bQ80U49 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep170bQ80U49 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep170bQ80U49 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms