Protein–RNA interactions for Protein: Q80U22

Rusc2, Iporin, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rusc2Q80U22 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Rusc2Q80U22 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rusc2Q80U22 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rusc2Q80U22 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rusc2Q80U22 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Rusc2Q80U22 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rusc2Q80U22 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms