Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ClmQ7TSN2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ClmQ7TSN2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms