Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccp110Q7TSH4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccp110Q7TSH4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms