Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Prrc2bQ7TPM1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prrc2bQ7TPM1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prrc2bQ7TPM1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms